"Ion channels through the lens of chemistry".

Journée Scientifique de la Fédération de Recherche Physique et Chimie du Vivant - Orléans.

Les lauréats 2024

Médaille de bronze

Guilhem Chaubet, Chémo-Biologie Synthétique et Thérapeutique [CBST] ex laboratoire CAMB.

Médaille d’argent

Nicolas Giuseppone, Institut Charles Sadron [ICS].

Médaille de cristal

Mathilde Büchler, Délégation Alsace du CNRS [MOY1000].

Marie-Hélène Sigward, Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien [IPHC].

Médaille de cristal collectif

Projet MAPS | Monolithic active pixel sensors | Détecteurs à pixels, Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien [IPHC] : Franck Agnèse, Gregory Bertolone, Gilles Claus, Claude Colledani, Andrei Dorokhov, Mathieu Goffe, Fabienne Hamel, Christine Hu-Guo, Maciej Kachel, Frédéric Morel, Isabelle Valin, Christophe Wabnitz.

Participation sur invitation

"PIEZO channels: Thriving under pressure and now activated by light".

Journée scientifique du Département STS (Science et Technologie pour la Santé) de l'Université de Bordeaux, Domaine du Haut Carré, campus de Talence

Le 25 novembre à 11h en visioconférence.

Les inscriptions pour le 9ème Annual Meeting de France-BioImaging les 20 et 21 novembre 2024 à Strasbourg à la Bibliothèque Nationale et Universitaire de Strasbourg (6 Pl. de la République, 67000 Strasbourg) sont ouvertes jusqu'au 11/10/2024. 

UCSF, San Francisco

Ambassadeur CNRS Chimie 2024

donnera une conférence intitulée :

Overcoming the Undruggable Nature of the Most Common Oncogene K-Ras

The Shokat lab uses chemical genetics to study and target signaling proteins, with the aim of finding new ways to treat human diseases. Many projects in the lab have focused on kinases, GTPases and RNA helicases, including some of the most important proteins in cancer, such as mTOR, Ras and CDK4. We are also interested in other signaling proteins, such as the dual kinase/GTPase LRRK2, which is relevant in Parkinson's disease, and the translational regulator helicase DDX3.

Chemical genetics combines the timing and dose control of small molecules with the absolute specificity of genetics. Small molecules are invaluable tools for studying proteins, but it can be hard to find one that targets a single member of a family of proteins. We take advantage of the chemical difference that results from a mutation to allow us to target a protein specifically, leaving other similar proteins untouched.

Site web 

Plan 

“A surprising Crossroad between ATP-gated P2X Receptors and PIEZO Channels”

au XIII Meeting of the Brazilian Purine Club, à Santos au Brésil.

Offre de post-doctorat en nanosciences et innovation biomédicale

Descriptif du projet

Le post-doctorat proposé s’inscrit dans le cadre du projet de recherche CaDoRNA financé par l’Agence Nationale de la Recherche. Ce projet vise à concevoir, synthétiser et évaluer l’activité biologique de carbon dots (CDs) permettant de faire de la délivrance de siRNA contrôlée par la lumière, associée à de la thérapie photodynamique. Les CDs sont des nanoparticules carbonées qui possèdent des propriétés exceptionnelles : facilité de synthèse et de fonctionnalisation à partir de matières premières largement disponibles, taille nanométrique, stabilité chimique, haute solubilité/dispersibilité dans l'eau et fluorescence intrinsèque, permettant leur suivi dans la cellule par imagerie. De plus, ils ont été décrits très récemment comme de puissants agents de délivrance d'acides nucléiques. Les CDs qui seront développés dans le cadre du présent projet seront dopés par un photosensibilisateur et décorés en surface par des espèces cationiques via un lien chimique sensible à l'oxygène singulet. Ainsi, ils agiront comme vecteurs de siARN, grâce à leurs charges cationiques permettant de complexer l’acide nucléique, et produiront sous irradiation lumineuse, grâce au photosensibilisateur, de l'oxygène singulet qui permettra une libération spatio-temporelle précise du siARN mais également de faire de la photothérapie dynamique.  

Missions du post-doctorant

Le post-doctorant aura en charge d’évaluer l’activité biologique des CDs produits par les chimistes de l’équipe, en collaboration avec un doctorant. Il s’agira en particulier d’étudier l’internalisation et la distribution cellulaires des complexes CDs/siARN, ainsi que la dissociation intracellulaire de ces complexes dans des cellules en culture sous l’effet de la lumière, en lien avec l’efficacité de transfection des complexes. La mise en œuvre de ces travaux fera principalement appel à des techniques de culture cellulaire, imagerie de fluorescence (confocal et épifluorescence) et cytométrie en flux.

Qualifications et compétences recherchées

• Formation à la recherche en biologie cellulaire et connaissance des problématiques de délivrance de principes actifs thérapeutiques assistée par des nanoparticules à l’échelle cellulaire.
• Compétences en culture cellulaire, imagerie cellulaire de fluorescence (confocal et épifluorescence), analyse quantitative d’images, cytométrie en flux.
• Soft skills :  dynamisme, engagement et sérieux, sens de l’organisation, autonomie et prise d’initiative, capacité à travailler en équipe et à communiquer.

Indication du poste

• Contrat à durée déterminée de 18 mois à temps plein.
• Date prévisible d’embauche : 15/02/2025.
• Lieu de travail :  équipe Nanoparticules intelligentes, Laboratoire de Chémo-biologie Synthétique et Thérapeutique (CBST), UMR 7199 CNRS-Unistra, Faculté de Pharmacie, Illkirch, France.
• Niveau d’étude et d’expérience souhaité : doctorat soutenu avec une expérience de post-doctorat < 2 ans.

Contact et modalités de candidature

• Contact : Pr Françoise Pons, co-responsable de l’équipe Nanoparticules intelligentes.
• Modalités de candidature : CV et lettre de motivation adressés par mail au plus tard le 15/01/2025.

Carte

Actus NPI

Un projet collaboratif d'envergure
Le travail de Marine s’inscrit dans une initiative ambitieuse lancée par l’équipe de Sophie Martin pour valider les miRNA comme biomarqueurs diagnostiques et outils thérapeutiques contre les cancers ORL. Ce projet bénéficie de collaborations de premier ordre, notamment avec l’équipe Matériaux Photoactifs et Bioimagerie d’Andrey Klymchenko, de la startup BrightSens Diagnostics, de l’unité Anticipe (INSERM U1086) et de la plateforme ORGAPRED de Caen, du CHRU de Strasbourg- Hautepierre, et l’ICANS - Institut de Cancérologie Strasbourg Europe.

Toutes nos félicitations Marine !

©Fondation ARC

Introduction to image processing and analysis with Fiji/ImageJ

CDD de 14 mois à pourvoir à compter du 01/12/2024

Catégorie : A        Corps : Ingénieur de recherche  

Rémunération selon grille de la Fonction Publique 

Mission :

• Gérer des cultures de lignées cellulaires.
• Conduire et adapter des méthodes expérimentales en utilisant un ensemble de techniques (tests de viabilité cellulaire, microscopie, cytométrie, etc.), afin d'analyser l'effet de composés biologiques et chimiques sur les cellules.
• Exploiter et présenter les résultats des analyses et en assurer le suivi et la qualité.
• Rédiger des protocoles expérimentaux et des rapports.
• Communiquer avec l'ensemble de l'équipe de recherche et planifier les expériences en fonction des besoins et des priorités.
• Former les étudiants de l'équipe aux principes de la culture cellulaire et aux tests de routine.
• Participer et assurer le bon fonctionnement du laboratoire de culture cellulaire.
• Participer à la vie et à l'organisation du laboratoire.
• Appliquer les principes et les règles d'hygiène et de sécurité.

Activités principales :

Dans le cadre d'une recherche visant à développer des thérapies anticancéreuses ciblées, le candidat recruté mettra en œuvre des tests cellulaires (viabilité, clonogénicité, effet by-stander) pour mesurer la toxicité et l’efficacité des composés testés.

Activités associées :

Le candidat fournira des cellules pour des expériences biophysiques et des analyses de cellules uniques. Le candidat travaillera en étroite collaboration avec les chercheurs de l'équipe et d'autres plateformes d'analyse.

Contact pour renseignements sur le poste : Dr Guilhem Chaubet, co-directeur de l’équipe Chimie Biofonctionnelle

 Mail : chaubet[at]unistra.fr; Tel : 0368854295

Pour postuler, adressez votre CV et lettre de motivation au plus tard le 12/11/2024 à l’adresse suivante : chaubet[at]unistra.fr

Actus CBF

Actus NPI

Samuel a réalisé sa thèse dans l’équipe "Nanoparticules Intelligentes" du CBST sous la direction de Luc Lebeau et Françoise Pons. Il a été financé, pour ce travail, par le fonds « Blanche-VLM » en partenariat avec l'association « Vaincre la mucoviscidose ».

Actualités NPI

Actualités ICI

Actualités ICI

Une caractérisation approfondie de la phototransformation des fluorophores à base de Perylene Bis Imides (PBI) couplés au furane et au pyrrole, a révélé leurs remarquables propriétés de photoconversion et de photoactivation. Nos résultats indiquent qu'une photocyclisation rapide se produit, permettant la création de nouveaux bionanomatériaux photoconvertibles. Ces matériaux avancés ont été utilisés avec succès pour l’imagerie des vésicules intracellulaires, démontrant ainsi leur potentiel pour des applications novatrices en imagerie cellulaire.

Actualités CSP

Actualités CBF

Programme préliminaire:

• Introduction aux propriétés d'une image numérique
• Qu'est-ce que ImageJ/Fiji
• Ouvrir, importer, sauvegarder et exporter des images
•  Les différents paramètres d'une image (résolution, 3D, 4D, temps, canaux, etc.)
•  La manipulation d'une pile d'image
• Les opérations sur le contraste et la luminosité
• Sélection et régions d'intérêt
• Les différentes types de mesures 
• Segmentation des images (seuillage, apprentissage machine, apprentissage profond, etc.)
• Automatiser les protocoles avec le langage de script Macro ImageJ
• Utiliser des plugins

Pré-requis: savoir utiliser un ordinateur

Lieu: salle informatique B100, Faculté de Pharmacie, Illkirch

Langue: anglais (formateurs francophones)

Sessions: L'atelier est réparti sur 2 journées

Frais d'inscription: gratuit

S'inscrire

Un avantage majeur de cette approche est qu'elle permet la détection directe de l'ARN viral dans les échantillons cliniques, sans nécessiter d'amplification enzymatique ni d'extraction complexe d'acides nucléiques. Cette avancée technologique offre des perspectives prometteuses pour accélérer le diagnostic moléculaire des maladies et faciliter les tests à haut débit dans les laboratoires médicaux.

Félicitations à la première auteure, Elisabete Silva de BrightSens Diagnostics, ancien membre de l'équipe Klymchenko, et à tous les coauteurs.

Direct Zeptomole Detection of RNA Biomarkers by Ultrabright Fluorescent Nanoparticles on Magnetic Beads Elisabete Cruz Da Silva, Paraskevi Gaki, Fabien Flieg, Melanie Messmer, Floriane Gucciardi, Yevheniia Markovska, Andreas Reisch, Samira Fafi-Kremer, Sébastien Pfeffer, Andrey S. Klymchenko

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/smll.202404167

Nouvelles sondes pour l’imagerie des gouttelettes lipidiques

Nathan Aknine, doctorant dans l’équipe Matériaux Photoactifs et Bioimagerie, a récemment publié avec son directeur de thèse, Andrey Klymchenko, un article présentant des sondes innovantes pour l’imagerie des gouttelettes lipidiques (LD) dans les cellules vivantes. Ces nouveaux colorants solvatochromes, basés sur des noyaux de naphtalène et de fluorène avec un groupe trifluoroacétyle, permettent de détecter avec une grande précision la polarité locale des LD et de révéler des caractéristiques telles que l’insaturation lipidique et la longueur des chaînes.

Ces sondes marquent une avancée significative dans la recherche sur les processus métaboliques et cellulaires en offrant une meilleure résolution et une sensibilité accrue par rapport aux colorants traditionnels, comme le rouge du Rouge Nil. L’étude révèle également que la polarité dans le centre de LDs peut être influencée par des régimes d’acides gras, ouvrant de nouvelles perspectives pour la recherche en biologie cellulaire.

Nathan Aknine and Andrey S. Klymchenko. Push–Pull Fluorescent Dyes with Trifluoroacetyl Acceptor for High-Fidelity Sensing of Polarity and Heterogeneity of Lipid Droplets. Anal. Chem. 2024, 96, 32, 13242–13251

https://doi.org/10.1021/acs.analchem.4c02322

Dans une deuxième publication, Nathan Aknine avec Rémi Pelletier et Andrey Klymchenko présentent une nouvelle approche de marquage des membranes cellulaires grâce à des sondes fluorescentes innovantes, nommées MemGraft. Contrairement aux sondes classiques, ces nouvelles sondes se lient de manière covalente aux protéines membranaires après un ancrage temporaire à la membrane lipidique, garantissant une stabilité accrue même dans des conditions complexes comme la fixation et la perméabilisation.

Les sondes MemGraft permettent également le codage à barres de plusieurs populations cellulaires sur différentes couleurs et offrent un suivi à long terme des cellules en co-culture, sans perte de signal. Cette innovation ouvre la voie à des applications en ingénierie cellulaire, en imagerie vidéo et dans des études nécessitant le suivi prolongé des cellules.

Lipid-directed covalent fluorescent labeling of plasma membranes for long-term imaging, barcoding and manipulation of cells

Nathan Aknine, Remi Pelletier, Andrey S. Klymchenko

bioRxiv 2024.07.28.605476; doi: https://doi.org/10.1101/2024.07.28.605476

Événements passés CBF

New insights into P2X7 receptor function: implications for pathology

au 2nd European Purine Meeting à Ferrara, Italie.

Événements passés ICI

Actualités CSP

Les organoïdes, ces structures cellulaires auto-organisées reproduisant la complexité et la fonctionnalité des organes humains, sont de précieux outils pour étudier la biologie des tumeurs et tester l'efficacité de nouveaux traitements. En reproduisant fidèlement les caractéristiques des tumeurs humaines, ils permettent aux chercheurs de mieux comprendre les mécanismes de la maladie et d’être utilisés pour prédire la réponse d'un patient à un traitement spécifique.
 

Equipe OnKO 3T