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Services communs et Plateformes techniques

Plateforme d’Analyse Chimique de Strasbourg Illkirch (PACSI)

Responsables du PACSI

- Responsable pilotage scientifique et administratif PACSI :

Delphine GARNIER - IE CNRS, Laboratoire de Conception et Application de Molécules Bioactives - UMR 7199

 

Contacts:

Delphine GARNIER : IE CNRS  - d.garnier@unistra.fr

Estefania OLIVA : Ingénieur UDS - eoliva@unistra.fr

 

Téléphone: 03 68 85 41 29 (RMN et Masse)

Localisation : Faculté de Pharmacie - Batiment F, Salle F011-F017 - 74 route du rhin - 67401 ILLKIRCH

 

 

Descriptif du PACSI

La Plateforme d’Analyse Chimique de Strasbourg-Illkirch (PACSI) regroupe les services de Résonance Magnétique Nucléaire (RMN) et de spectrométrie de masse (MS) de la Faculté de Pharmacie de l’Université de Strasbourg.

Fort d’un savoir-faire et d’une expertise en RMN et en spectrométrie de masse, le PACSI vous propose ses services pour l’analyse structurale de molécules, l’analyse de spectres, la détermination de masse exacte ou de formule brute de molécules organiques, qu'elles soient naturelles ou de synthèse. Les services du PACSI sont accessibles à tout étudiant, doctorant, post-doctorant et chercheur de laboratoires publics ou privés qu’ils soient ou non localisés sur le campus d’Illkirch, dans la mesure où le PACSI a la capacité à les assurer.

Ces plateformes sont accessibles à tout étudiant, doctorant, post-doctorant et chercheur de laboratoires universitaires et privés.

 

Équipements

- Spectromètre RMN Bruker Avance III - 400 MHz muni d’un passeur automatique d’échantillons
Sonde BBFO+
 5 mm (multi-noyaux dont Fluor)

Analyses 1D et 2D en routine ou à la demande

 

- Spectromètre RMN Bruker Avance III - 500 MHz muni d’un passeur automatique d’échantillons
Sonde BBFO+ 5 mm (multi-noyaux dont Fluor) 
Sonde inverse duale en flux LC-NMR 30 μL, H-X-D, ATM
Sonde en flux CapNMRTM 5 μL

Analyses 1D et 2D en routine ou à la demande (demande sur place)

- GC-MS, basse ou haute résolution
GC : Agilent 7890
Sources : IE/FI
Analyseur : ToF, Jeol AccuToF CCV

Analyse de molécules volatiles apolaires à peu polaires.
Comparaison de structure avec base de données NIST.
Demande à déposer sur le site http://sca.u-strasbg.fr

- LC-UV-MS/MS, haute résolution
LC : Agilent 1200
Sources : ESI ou APCI
Analyseur : Q-ToF en tandem, Agilent Accurate Mass QToF 6520

Analyse haute résolution de molécules peu polaires à polaires. Fragmentation MS2.
Détermination de la masse exacte.
Demande à déposer sur le site http://sca.u-strasbg.fr

- LC-DAD-MSn-SPE/NMR
LC : Agilent 1200
Sources : ESI  ou APPI
Analyseur : Trappe à ions, HCT Ultra Bruker
SPE : Prospekt II, Spark Holland
NMR : Spectromètre RMN Bruker Avance III - 500 MHz

Sondes : Sonde inverse duale en flux 30 μL, H-X-D, ATM
Sonde en flux CapNMRTM 5 μL

Analyse de molécules peu polaires à polaires, de masse inférieure à 6000 g/mol. Fragmentation MSn.
Système couplé permettant l’isolation et l’identification structurale de molécules même si elles ne sont présentes qu’en très faible quantité et dans des mélanges complexes.

Tarification

Les tarifs sont fournis sur demande.

Plate-forme de Chimie Biologique Intégrative de Strasbourg (PCBIS)

La Plate-forme de Chimie Biologique Intégrative de Strasbourg (PCBIS) : Un laboratoire de pointe spécialisé dans le criblage à haut débit

La PCBIS (Unité Mixte de Service CNRS-UdS), comprend la chimiothèque, la ciblothèque et le criblage robotisé à haut débit qui permet de réaliser plus de 10000 tests par jour. Elle est la première plate-forme publique de découverte du médicament en Europe

Créée en 1999, la PCBIS, possède une chaîne de ressources et de compétences permettant d’accélérer la découverte de molécules bioactives. Ses prestations spécifiques s’étendent de la molécule aux tests in vitro et in vivo et s’articulent autour de différents services ouverts aux laboratoires publics ou aux industriels privés.

Développement de tests à façon

Les services « Criblage » et « Ciblothèque » assurent la validation et la miniaturisation des modèles biologiques, ainsi que la production des cibles moléculaires et cellulaires destinées au criblage (du clonage à l'expression en cellules eucaryotes et à l'obtention de lignées cellulaires stables ou transitoires).

Criblage robotisé (HTS)

Maîtrisant les outils validés par l’industrie pharmaceutique, le service « Criblage » réalise les tests robotisés des molécules sur les modèles biologiques et l’analyse des résultats afin d’initier la recherche de nouvelles molécules destinées à la composition de médicaments à venir. Les compétences de ce service sont proposées aux laboratoires académiques et commercialisées pour des jeunes pousses ou industries désirant accéder à ces technologies

La chimiothèque

Le service « Chimiothèque » collecte et conditionne des molécules synthétisées par les chimistes ainsi que des produits naturels destinés au criblage et propose des études de relations structure-activité.  À ce jour, elle compte plus de 6000 molécules.

Pour renforcer ses prestations la PCBIS s’est associée à un service d’analyses (TechMedILL) qui permet d’évaluer les propriétés ADME-Toxicité des molécules actives.

 

Gage de la qualité de ses services, la PCBIS a obtenu le label international ISO 9001. Labellisée IBiSA au niveau National et intégrée dans le projet Européen Eu-Openscreen, la PCBIS poursuit sa recherche de composés actifs afin de trouver des futurs médicaments dans les pathologies connues mais aussi les maladies rares ou négligées.

 

Contact : Plate-forme de Chimie Biologique Intégrative de Strasbourg (PCBIS) - UMS 3286 CNRS-Université de Strasbourg - Ecole Supérieure de Biotechnologie et Faculté de Pharmacie -  Boulevard Sébastien Brant - 67412 ILLKIRCH - 03 68 85 48 71 - www.pcbis.fr

 

 

 

La Plate-Forme eBioCyt "Bio-essais pharmacologiques et pharmacocinétiques en cytomique"

La Plate-Forme eBioCyt UPS1401

"Bio-essais pharmacologiques et pharmacocinétiques en cytomique"

Directrice : Pr Genevieve Ubeaud-Séquier

Ingénieur de recherche : Dr Jean Peluso, contractuel

 

Missions et Engagement de eBioCyt
 UPS1401

eBioCyt est une plate-forme de mise au point de bio-essais pharmacologiques et pharmacocinétiques en micro-volumes et lecture rapide mais aussi de tests en routine de réponse cellulaire permettant le criblage à haut débit au format 96 puits.
eBioCyt a été créée pour optimiser, valoriser et mettre au service de la communauté, les expertises technologiques en cytomique développées par le Dr J Peluso en y intégrant l’expertise en ADME/Tox du Pr G. Ubeaud-Séquier. Ses principes fondateurs sont la mutualisation de moyens et l’intégration des politiques de ressources de haute technologie du laboratoire au sein d'une structure ouverte.


eBioCyt valorise son potentiel technologique en proposant des offres transversales de mise au point de tests pharmacologiques en cytomique.


La plate-forme eBioCyt UPS1401 a plusieurs missions :

-       Répondre aux besoins des utilisateurs pour l’acquisition de données en cytométrie et l’analyse de ces données et réaliser des prestations de service en fonction des capacités (infrastructure, équipement, personnel et expertise) de la structure, en proposant des tests existants adaptés aux besoins des équipes de recherche et en contribuant au développement des projets de recherche (académiques et privés).


-       Mettre à disposition du matériel et des techniques pour réaliser des études en cytométrie  avec un service accompagné.

-       
Valoriser le savoir-faire par des publications, la rédaction de contrats de valorisation et des formations (initiales et continues).

Compétences

eBioCyt est une plate-forme de tests en routine avec des méthodologies originales en cytomique (ADME, toxicité, inflammation, apoptose). Il s’agit de tests pharmaco-toxico-cinétiques cellulaires validés en criblage haut débit, de tests d’immuno-marquage et d’expression protéique. eBioCyt propose également la mise au point de bio-essais pharmacologiques et pharmacocinétiques en micro-volumes et lecture rapide en cytométrie en flux. Cette plateforme de technologie innovante (criblage haut débit, cytométrie cellules adhérentes, développement de modèles cellulaires 2D/3D et co-cultures) permet d’assurer une contribution importante à la recherche locale. Depuis sa création, la plate-forme eBioCyt a montré l’intérêt de la structure dans l’environnement scientifique local et a supporté des développements dans le cadre de projets d’envergure internationale. Les axes scientifiques et techniques forts sont i) le criblage haut débit pour des études de pharmacologie et d’ADME-Tox cellulaire, ii) le développement d’un nouveau modèle cellulaire hépatique à visées toxicologique (idiosyncrasie, cholestase, stéatose) et métabolique et iii) le développement de nouveaux modèles cellulaires 3D appliqués à des études précliniques pharmacologiques, pharmacocinétiques et de toxicité.

Structure/ Equipement

La plateforme eBioCyt UPS 1401 comprend une salle d’appareillages et une salle de culture cellulaire attenante.

Les appareillages de la plate-forme, tous au format 96 puits, comprennent :

- un cytomètre capillaire Guava® easyCyte Plus™ HT (Millipore/Merck) à laser bleu qui mesure 7 paramètres/cellule (taille, granulation, dénombrement, fluorescence à 525, 583, 680 et 785 nm)

- un cytomètre pour cellules adhérentes à disposition : Celligo (Cyntellect) qui mesure 6 paramètres/cellule (forme, nombre, granulation, fluorescence 447, 536 et 629 nm)



 

La salle de culture cellulaire de la plateforme eBioCyt est constituée de 3 hottes à flux laminaire, 1 incubateur Air/C02 (95/5), 1 microscope, 1 centrifugeuse et 1 réfrigérateur/congélateur)

 

Fonctionnement

eBioCyt est une plateforme labellisée UPS1401 située à la faculté de Pharmacie à Illkirch, ouverte à l’ensemble des équipes de l’Université de Strasbourg, aux équipes académiques extérieures à l’Université de Strasbourg et à la communauté industrielle nationale et internationale. La facturation des prestations est calculée selon des coûts horaires de cytométrie validés par le CA de l’Université de Strasbourg.

Les prestations sont réalisées après discussion avec le service demandeur, accord signé d’un devis de l’UPS1401 et obtention d’un bon de commande du service demandeur.

 

Pour tout contact :      Pr G. Ubeaud-Séquier

e-mail : ubeaud@unistra.fr / Tél : + 33 (0)3 68 85 42 11

Dr J Peluso

e-mail : jpeluso@unistra.fr  / Tél : + 33 (0)3 68 85 42 54

 

Rapport d'activité 2016 et 2017

télécharger la plaquette en pdf ici

 

Plateforme d'imagerie quantitative (PIQ)

Site  : http://imageriepiq.u-strasbg.fr/?lang=en

Présentation:
La Plate-forme d’Imagerie Quantitative (PIQ) a été créé le 1er janvier 2009 pour mutualiser et mettre à disposition de la communauté les moyens en microscopie acquis ou développés par la Faculté de Pharmacie et l’ESBS. Cette plate-forme regroupe des instruments commerciaux ainsi que des instruments à la pointe de la technologie développés au sein du PIQ. Grâce à ces développements et la mutualisation des moyens techniques et humains du site, le PIQ s’est considérablement enrichi depuis sa création. La spécificité du PIQ est de privilégier les modalités en microscopie permettant de paramétriser quantitativement les phénomènes observés.

Fonctionnement:
La plateforme est hébergée par la Faculté de Pharmacie, tous les moyens matériels et humains sont mis à disposition par le Laboratoire de Biophotonique et de Pharmacologie. Le comité de pilotage est constitué du Doyen de la Faculté de Pharmacie, du Directeur de l’ESBS, des directeurs de laboratoires concernés, du directeur du PIQ et d’un représentant de la plateforme IBISA de l’IGBMC. Il se réuni au minimum une fois par an et veille à ce que le PIQ reste au meilleur niveau technologique et scientifique possible.

Historique:
Depuis l’achat du premier microscope confocal par les équipes de biologie de la Faculté de Pharmacie et de l’Ecole Supérieure de Biotechnologie de Strasbourg en 1998, l’évolution très rapide des techniques d’imagerie cellulaire, les besoins des chercheurs et la restructuration de la recherche sur le site d’Illkirch appellent une organisation claire, simple et souple de l’accès de ses équipes de recherche aux moyens et techniques de cette discipline, sous la forme d’un Service Commun appelé Plateau d’Imagerie Quantitative (PIQ).

L’Institut Fédératif Gilbert Laustriat créé au 1er janvier 1999 (IFR 85) a terminé son mandat le 1er janvier 2009. L’IFR85 était en charge de la gestion de plusieurs plateaux techniques dont, notamment :

La plate-forme de microscopie confocale dirigée par le Dr. P. Rondé, qui comprend un système de microscopie confocale Biorad 1024 et une station d’analyse et de traitement d’images.

En outre, à l’ESBS existait jusqu’au 1er janvier 2009 une plate-forme d’imagerie cellulaire dirigée par le Pr. J. De Mey et comprenant un système de microscopie multidimensionnelle Leica AS MDW, un système de microscopie vidéo multipositionnelle Leica FW 4000, un système de microinjection de cellules adhérentes, et des stations d’analyse et de traitement d’images.

Par ailleurs, le Dr. P. Rondé et le Pr. J. De Mey ont acquis une station d’imagerie cellulaire multimodale de dernière génération, l’IMIC, qui permet encore d’étendre la gamme de techniques en imagerie fonctionnelle disponibles localement.

A la Faculté de Pharmacie, l’équipe du Pr Yves Mély a développé une plate-forme d’imagerie quantitative à deux photons, combinant de l’imagerie à deux photons, de la spectroscopie à corrélation de fluorescence simple et croisée (FCS et FCCS) et de l’imagerie par temps de vie de fluorescence (FLIM). Ce système avec une source laser femtoseconde est un des plus performants, développés en France. Cette même équipe vient également de développer un dispositif de mesures en molécules uniques, pour suivre du transfert d’énergie (FRET) en mode imagerie sur des molécules individuelles.

Afin de remédier à la fermeture de l’IFR85 et de pérenniser ces deux plates-formes, la Faculté de Pharmacie a mis à la disposition du PIQ des locaux où sont regroupés les équipements d’imagerie cellulaire.

Plus d'informations : http://imageriepiq.u-strasbg.fr/?lang=en