Services communs et plateformes techniques

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PACSI  Plateforme d'analyse chimique de Strasbourg Illkirch

Responsables de la PACSI

  • Responsable pilotage scientifique et administratif PACSI : Delphine GARNIER

Contact

+33 (0)3 68 85 41 29 (RMN et Masse)
Localisation :

Faculté de pharmacie
Bâtiment F - Salle F011-F017
74 route du Rhin - CS 60024
67401 ILLKIRCH-GRAFFENSTADEN Cedex

Afin d'obtenir des identifiants d'accès pour le site de dépôt des demandes de masse (sca.u-strasbg.fr), veuillez retourner la fiche d'inscription signée par vous-même et votre chef d'équipe. Elle est à télécharger en version française et en version anglaise.

Descriptif de la PACSI

La Plateforme d’analyse chimique de Strasbourg-Illkirch (PACSI) regroupe les services de Résonance magnétique nucléaire (RMN) et de spectrométrie de masse (MS) de la Faculté de pharmacie de l’Université de Strasbourg.

Fort d’un savoir-faire et d’une expertise en RMN et en spectrométrie de masse, la PACSI vous propose ses services pour l’analyse structurale de molécules, l’analyse de spectres, la détermination de masse exacte ou de formule brute de molécules organiques, qu'elles soient naturelles ou de synthèse. Les services de la PACSI sont accessibles à tout étudiant, doctorant, post-doctorant et chercheur de laboratoires publics ou privés qu’ils soient ou non localisés sur le campus d’Illkirch, dans la mesure où la PACSI a la capacité de les assurer.

Ces plateformes sont accessibles à tout étudiant, doctorant, post-doctorant et chercheur de laboratoires universitaires et privés.

Équipements

  • Spectromètre RMN Bruker Avance III - 400 MHz muni d’un passeur automatique d’échantillons
    • Sonde BBFO+
 mm (multi-noyaux dont Fluor)

    Analyses 1D et 2D en routine ou à la demande

  • Spectromètre RMN Bruker Avance III - 500 MHz muni d’un passeur automatique d’échantillons
    • Sonde BBFO+ 5 mm (multi-noyaux dont Fluor) 
    • Sonde inverse duale en flux LC-NMR 30 μL, H-X-D, ATM
    • Sonde en flux CapNMRTM 5 μL

    Analyses 1D et 2D en routine ou à la demande
    Demande sur place

    GC-MS, basse ou haute résolution
    • GC : Agilent 7890
    • Sources : IE/FI
    • Analyseur : ToF, Jeol AccuToF CCV

    Analyse de molécules volatiles apolaires à peu polaires.
    Comparaison de structure avec base de données NIST
    Demande à déposer sur le site de la PACSI

  • LC-UV-MS/MS, haute résolution
    • C : Agilent 1200
    • Sources : ESI ou APCI
    • Analyseur : Q-ToF en tandem, Agilent Accurate Mass QToF 6520

    Analyse haute résolution de molécules peu polaires à polaires. Fragmentation MS2.
    Détermination de la masse exacte
    Demande à déposer sur le site de la PACSI

  • LC-DAD-MSn-SPE/NMR
    • LC : Agilent 1200
    • Sources : ESI u APPI
    • Analyseur : Trappe à ions, HCT Ultra Bruker
    • PE : Prospekt II, Spark Holland
    • NMR : Spectromètre RMN Bruker Avance III - 500 MHz

    • Sondes :
      • Sonde inverse duale en flux 30 μL, H-X-D, ATM
      • Sonde en flux CapNMRTM 5 μL

    Analyse de molécules peu polaires à polaires, de masse inférieure à 6000 g/mol. Fragmentation MSn.
    Système couplé permettant l’isolation et l’identification structurale de molécules même si elles ne sont présentes qu’en très faible quantité et dans des mélanges complexes.

Tarification

Les tarifs sont fournis sur demande.



eBioCyt  Plateforme Bio-essais pharmacologiques et pharmacocinétiques en cytomique - UPS 1401

Responsables de la plateforme

  • Directrice : Pr Geneviève Ubeaud-Séquier
  • Ingénieur de recherche : Dr Jean Peluso

Contact

Pr Geneviève Ubeaud-Séquier
+ 33 (0)3 68 85 42 11
ubeaud[at]unistra.fr

Dr Jean Peluso
+ 33 (0)3 68 85 42 54
jpeluso[at]unistra.fr

Missions et engagement de eBioCyt
 - UPS 1401

eBioCyt est une plateforme de mise au point de bio-essais pharmacologiques et pharmacocinétiques en micro-volumes et lecture rapide mais aussi de tests en routine de réponse cellulaire permettant le criblage à haut débit au format 96 puits.
eBioCyt a été créée pour optimiser, valoriser et mettre au service de la communauté, les expertises technologiques en cytomique développées par le Dr Jean Peluso en y intégrant l’expertise en ADME/Tox du Pr Geneviève Ubeaud-Séquier. Ses principes fondateurs sont la mutualisation de moyens et l’intégration des politiques de ressources de haute technologie du laboratoire au sein d'une structure ouverte.


eBioCyt valorise son potentiel technologique en proposant des offres transversales de mise au point de tests pharmacologiques en cytomique.


La plateforme eBioCyt - UPS 1401 a plusieurs missions :

  • répondre aux besoins des utilisateurs pour l’acquisition de données en cytométrie et l’analyse de ces données et réaliser des prestations de service en fonction des capacités (infrastructure, équipement, personnel et expertise) de la structure, en proposant des tests existants adaptés aux besoins des équipes de recherche et en contribuant au développement des projets de recherche (académiques et privés),
  • mettre à disposition du matériel et des techniques pour réaliser des études en cytométrie  avec un service accompagné,
  • 
valoriser le savoir-faire par des publications, la rédaction de contrats de valorisation et des formations (initiales et continues).

Compétences

eBioCyt est une plateforme de tests en routine avec des méthodologies originales en cytomique (ADME, toxicité, inflammation, apoptose). Il s’agit de tests pharmaco-toxico-cinétiques cellulaires validés en criblage haut débit, de tests d’immuno-marquage et d’expression protéique. eBioCyt propose également la mise au point de bio-essais pharmacologiques et pharmacocinétiques en micro-volumes et lecture rapide en cytométrie en flux. Cette plateforme de technologie innovante (criblage haut débit, cytométrie cellules adhérentes, développement de modèles cellulaires 2D/3D et co-cultures) permet d’assurer une contribution importante à la recherche locale. Depuis sa création, la plate-forme eBioCyt a montré l’intérêt de la structure dans l’environnement scientifique local et a supporté des développements dans le cadre de projets d’envergure internationale. Les axes scientifiques et techniques forts sont :

  1. le criblage haut débit pour des études de pharmacologie et d’ADME-Tox cellulaire,
  2. le développement d’un nouveau modèle cellulaire hépatique à visées toxicologique (idiosyncrasie, cholestase, stéatose) et métabolique,
  3. le développement de nouveaux modèles cellulaires 3D appliqués à des études précliniques pharmacologiques, pharmacocinétiques et de toxicité.

Structure / Équipement

La plateforme eBioCyt UPS 1401 comprend une salle d’appareillages et une salle de culture cellulaire attenante.

Les appareillages de la plate-forme, tous au format 96 puits, comprennent :

  • un cytomètre capillaire Guava® easyCyte Plus™ HT (Millipore/Merck) à laser bleu qui mesure 7 paramètres/cellule (taille, granulation, dénombrement, fluorescence à 525, 583, 680 et 785 nm)



La salle de culture cellulaire de la plateforme eBioCyt est constituée de

  • 1 hotte à flux laminaire,
  • 1 incubateur Air/C02 (95/5),
  • 1 microscope,
  • 1 centrifugeuse,
  • 1 réfrigérateur/congélateur.

Fonctionnement

eBioCyt est une plateforme labellisée UPS 1401 située à la Faculté de pharmacie à Illkirch, ouverte à l’ensemble des équipes de l’Université de Strasbourg, aux équipes académiques extérieures à l’Université de Strasbourg et à la communauté industrielle nationale et internationale. La facturation des prestations est calculée selon des coûts horaires de cytométrie validés par le CA de l’Université de Strasbourg.

Les prestations sont réalisées après discussion avec le service demandeur, accord signé d’un devis de l’UPS 1401 et obtention d’un bon de commande du service demandeur.


PIQ-QuESt  Plateforme d'imagerie quantitative

Présentation

La Plateforme d’Imagerie Quantitative (PIQ-QuESt) est la composante du pôle technologique QuESt située sur le site de la Faculté de Pharmacie de Strasbourg. Elle propose aux chercheurs académiques et industriels des solutions de microscopie photoniques adaptés à l’étude du vivant. La totalité de ses services d’expertise et de ses équipements sont mis à disposition par le Laboratoire de Bioimagerie et Pathologies (CNRS UMR 7021)

En service depuis 2009, elle s’est considérablement enrichie grâce à la mutualisation des moyens techniques et humains du site en privilégiant particulièrement les modalités de microscopie permettant de paramétrer quantitativement les phénomènes observés. En plus des instruments commerciaux, la spécificité de la plate-forme est de développer ses propres systèmes à la pointe de la technologie. Depuis 2014, en association avec plateforme ICI de l'IGBMC, elle forme la plateforme QuESt-IBISA et propose ainsi une offre complémentaire permettant d'imager de l'échelle moléculaire à l'animal entier.

Responsables de la plateforme

  • Responsable scientifique : Philippe Rondé -philippe.ronde[at]unistra.fr
  • Responsable operationel : Ludovic Richert -ludovic.richert[at]unistra.fr
  • Ingénieur d’étude : Romain Vauchelles -romain.vauchelles[at]unistra.fr

Contact

Site :  https://piq.unistra.fr/
Mail : quest-piq[at]unistra.fr


Localisation :

Faculté de pharmacie (RDC ailes E et D)
74 route du Rhin - CS 60024
F-67401 ILLKIRCH-GRAFFENSTADEN Cedex

Prestations

- Accès aux équipements de microscopie photonique librement ou avec l'assistance d'un ingénieur
- Accès à des logiciels d'analyse spécialisés
- Participation collaborative de la plateforme sur les projets de recherche (expertise pour le développement de protocoles d'acquisition et d'analyse d'images)
- Enseignements universitaires et formations continues
- Accès aux laboratoires de culture cellulaire

Technologies

Préparation d'échantillons

            - Deux salles de cultures cellulaire dédiées 
            - Postes de Sécurité Microbiologiques
            - Sorbonne
            - Nettoyeur à plasma pour préparer les lamelles

Imagerie de fluorescence

            - Microscopie confocale : spectrale /UV / conversion ascendante de photons
            - Microscopie à champ large : timelapse en environnement contrôlé / microinjection / conversion ascendante de photons 
            - Microscopie TIRF et multimodale
            - Microscopie à 2 photons

Biophysique et quantification

            - FLIM  (FLIM – FRET )
            - FCS ( sFCS, FCCS, FCS à deux foyers, RICS, N&B )
            - FRAP, Photodommage, Photoconversion, Optogénétique

Nanoscopie de molécule unique

            - dStorm 2D/3D
            - PALM 2D/3D
            - PAINT
            - smFRET
            - SMLM en feuille de lumière

Analyse d'images

4 stations d'analyses et un serveur de 200To sont en libre accès. Pour une partie des instruments développés au laboratoire, nous concevons nos propres interfaces de pilotage (Labview, Micromanager) Nous développons également des outils d’analyse à la demande des utilisateurs imageJ/FIJI, Cell profilter etc.) Nous avons également de nombreuses licences logicielles dédiées à l'analyse d'images de microscopie (Imaris, SPCImage, SIMfcs, Pulse 5...)